近日，华大基因在国际著名期刊Nature Communications上发表了题为“Genomic basis of the giga-chromosomes and giga-genome of tree peony Paeonia ostii”(凤丹牡丹超大染色体及巨大基因组的遗传机制)的牡丹基因组学最新研究成果。这一成果发现的背后是数位研究人员十年的心血与华大基因不断的投入。


突破时代，发现新功能

此研究成果不仅将牡丹科学研究带入了真正的基因组时代，而且也开启了牡丹分子育种及优质特异基因鉴定和功能解析与产业利用的新纪元。

GWAS揭示的牡丹高ALA合成相关的候选基因(SAD和FAD2)

牡丹，被誉为花中之王，是中国特有的世界著名花卉之一，也是传统中药材和重要的新兴油用资源作物，具有极高的经济价值、文化价值和社会价值。

牡丹基因组十分复杂，研究人员预测到了研究起来的难度很大，但是十年的研究时间依旧超乎了所有人的想象。索性研究人员能够静下心来，十年如一日地对牡丹进行不断研究。

对凤丹牡丹基因组，研究团队采用了逐级梯度建库策略(150@800bp、2kkkk k文库)及短读长测序技术(2.97Gb)，在测序组装分析过程中，研究团队孜孜不倦地进行技术方面的突破和创新，找到最适用于牡丹基因组的方法。与此同时，研究团队还借鉴学习基因组学领域众多走在科技前沿的技术，历经数百次/种软件测试、开发及应用分析和反复优化组装，曾先后形成过5个定型组装版本和3次完整(人工辅助)注释的拟发表版本，最终，才定下了目前最完善最合理的这一版本。


不断研究，领域突破

研究结果表明:在凤丹基因组中，约有33，0511条假基因和15，238个基因家族，即据我们所知，牡丹基因组中假基因和基因家族的数量是迄今已经测序的植物中最多的物种。这些大量假基因的产生可能与LTR在基因组的大量扩增相关。

凤丹染色体进化形成与维持机制

本研究采用被子植物12种代表性物种的系统进化分析结果，表明了牡丹所在的植物类数与牡丹出现的时间，这在牡丹的研究上是一个很重要的发现，也会为未来的许多研究带来很大的便利。

华大基因已经成功完成1，000多个物种的de novo测序，合作发表顶级期刊文章200+，其中29篇为封面文章;动植物重测序领域，华大集团累计发文200+篇，DNBSEQ™相关文章100+篇，影响因子1，000+;IF>20文章17篇。

在获得了这么大的成就之后，华大基因依旧会脚踏实地做好自己的本职工作，在研究道路上越走越远。在未来的日子里，华大基因还会投入更多的精力来提升自身，争取在医疗道路上有更大的突破，让中国的医疗市场走向全世界，为中国在医疗方面的成就打出名声，我们拭目以待吧!