国外研究

基因组测序:蚂蚁

作者: 来源:未知 2018-03-07 我要评论( )

2010年8月30日,深圳华大基因研究院对外宣布,来自亚利桑那州立大学、深圳华大基因研究院、纽约大学医学院、宾夕法尼亚大学医学院的国际研究小组在8月27日出版的《科学》杂志上发表

2010年8月30日,深圳华大基因研究院对外宣布,来自亚利桑那州立大学、深圳华大基因研究院、纽约大学医学院、宾夕法尼亚大学医学院的国际研究小组在8月27日出版的《科学》杂志上发表了弓背蚁与印度跳蚁的基因组。

蚂蚁基因组是华大基因启动的“千种动植物基因组计划”一期项目之一。弓背蚁与印度跳蚁在社会组织方式、分工类型的形态和行为以及捕食方式上均存在着很大差别。在一个有组织的蚂蚁社会中,蚁后具有更长的寿命,一般比工蚁的后代长10倍的寿命,比雄蚁更可长达500倍。通过比较弓背蚁与印度跳蚁的基因组,以及不同社会分型、不同发育阶段的基因表达情况,研究小组发现了与衰老过程、神经功能以及化学通讯相关的基因。

华大基因对弓背蚁与印度跳蚁的基因组测序深度都达到100倍,完成了这两种蚂蚁基因组的从头测序和组装工作。组装后的弓背蚁基因组大小为238Mb,印度跳蚁基因组约为297Mb,对全基因组的覆盖度均达到90%以上。来自深圳华大基因研究院的项目负责人张国捷博士说:“该项目获得的结果为使蚂蚁成为研究社会行为、衰老以及神经生物学的新模式生物奠定了基础,尤其为后续研究表观遗传对行为、衰老等过程的调控机制铺平了道路。”

纽约大学医学院霍华德·休斯医学研究所的项目负责人Danny Reinberg教授称:“我们目前正致力于对不同等级蚂蚁的DNA甲基化、组蛋白修饰及表观遗传调节的研究。蚂蚁具有多种社会组织方式,通过基于基因组测序的研究,并在DNA、RNA和表观水平上进行分析,我们可以更好地了解社会行为以及衰老过程的遗传学基础。”

截至目前,华大基因已与合作者启动了数量为百余种的动植物基因组测序分析一期项目,其中过半项目已经完成或接近尾声。除蚂蚁基因组外,大熊猫和黄瓜基因组研究成果已在《自然》及其系列杂志上发表。随着各项基因组成果的揭晓,动植物基因组的神秘面纱也将逐步拉开。

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